Um sistema de eletroforese consiste em dois componentes principais: uma fonte de alimentação e uma câmara de eletroforese. A fonte de alimentação fornece energia.O “poder”, neste caso, é a eletricidade.A eletricidade proveniente da fonte de alimentação flui, em uma direção, de uma extremidade à outra da câmara de eletroforese.O cátodo e o ânodo da câmara são o que atraem partículas com carga oposta.
Dentro da câmara de eletroforese há uma bandeja – mais precisamente, uma bandeja de fundição.A bandeja de fundição consiste nas seguintes partes: placa de vidro que fica no fundo da bandeja de fundição.O gel é mantido na bandeja de moldagem.O "pente" se parece com o seu nome. O pente é colocado em ranhuras na lateral da bandeja de fundição. Ele é colocado nas ranhuras ANTES de o gel quente e derretido ser derramado.Após a solidificação do gel, o pente é retirado.Os “dentes” do pente deixam pequenos buracos no gel que chamamos de “poços”.Os poços são feitos quando o gel quente e derretido se solidifica ao redor dos dentes do pente.O pente é retirado após o resfriamento do gel, deixando poços.Os poços fornecem um local para colocar as partículas que você deseja testar.Uma pessoa deve ter muito cuidado para não romper o gel ao carregar as partículas.Rachar ou quebrar o gel provavelmente afetará seus resultados.